Sunday, June 23, 2019

Antibiotics Classification in Antimicrobial susceptibility reports




بحسب مرجع CLSI  (Clinical and Laboratory Standards Institute).الأميركي لعام 2018 والذي يستند في معلوماته وتوجيهاته إلى FDA للاستعمالات السريرية في الولايات المتحدة الأمريكية. فإن الصادات الحيوية في تقارير التحسس الميكروبي يجب أن تكون موزعة ضمن مجموعات، وذلك على النحو الآتي:

1. Group A are considered appropriate for inclusion in a routine, primary testing panel, as well as for routine reporting of results for the specific organism groups.

المجموعة A : وتدرج ضمنها الصادات الأكثر أمانا ، والأقل تكلفة، والموصى بها من قبل FDA،وتعتبر تقارير التحسس عليها روتينية.

2. Group B includes antimicrobial agents that may warrant primary testing, but they may be reported only selectively, such as when the organism is resistant to agents of the same antimicrobial class, as in Group A. Other indications for reporting the result might include a selected specimen source (eg, a third-generation cephalosporin for enteric bacilli from CSF or trimethoprim-sulfamethoxazole for urinary tract isolates); a polymicrobial infection; infections involving multiple sites; cases of patient allergy, intolerance, or failure to respond to an antimicrobial agent in Group A; or for purposes of infection control.


المجموعة B: يتم اللجوء إليها في حال ظهور مقاومة أو تفاعل أليرجيائي لصادات المجموعة A، وهي صادات حيوية انتقائية مخصصة لحالات معينة (كالجيل الثالث للسيفالوسبورينات في التهاب السحايا الجرثومي أو الباكتريم في حالات الإنتان البولي).

3. Group C includes alternative or supplemental antimicrobial agents that may necessitate testing in those institutions that harbor endemic or epidemic strains resistant to several of the primary drugs (especially in the same class, eg, β-lactams); for treatment of patients allergic to primary drugs; for treatment of unusual organisms (eg, chloramphenicol for extraintestinal isolates of Salmonella spp.); or for reporting to infection control as an epidemiological aid.


المجموعة C: تضم صادات بديلة في حال مقاومة الجراثيم لصادات المجموعتين   AوB، ولها دور هام في كشف الحالات الوبائية، كما تضم صادات بديلة في حال سببت صادات المجموعتين AوB تفاعل أليرجيائي للمريض.



4. Group U (“urine”) includes certain antimicrobial agents (eg, nitrofurantoin and certain quinolones) that are used only or primarily for treating urinary tract infections (UTIs). These agents should not be routinely reported against pathogens recovered from other sites of infection. An exception to this rule is for Enterobacteriaceae in Table 1A, where cefazolin is listed as a surrogate agent for oral cephalosporins. Other antimicrobial agents with broader indications may be included in Group U for specific urinary pathogens (eg,Enterococcus and ciprofloxacin).
المجموعة U: تشمل الصادات الحيوية التي تطرح عن طريق الجهاز البولي ولها أهمية في علاج الإنتانات البولية.

5. Group O (“other”) includes antimicrobial agents that have a clinical indication for the organism group but are generally not candidates for routine testing and reporting in the United States.
المجموعة O: تضم الصادات الحيوية التي لها استطباب سريري تجاه نوع معين من الجراثيم، ولكنها بشكل عام غير مرشحة أو موصى بها للاختبارات الروتينية في الولايات المتحدة الأمريكية.

6. Group Inv (“investigational”) includes antimicrobial agents that are investigational for the organism group and have not yet been approved by the FDA for use in the United States.
المجموعة Inv: تضم الصادات الحيوية التي لها استطباب سريري تجاه نوع معين من الجراثيم، ولكن لم يتم اعتمادها من قبل FDA في الولايات المتحدة الأمريكية.
يفيد هذا التصنيف في علاج صادي موجه وفعال، مما يساهم في ترشيد استهلاك الصادات الحيوية والقضاء على الأنواع الميكروبية المقاومة والحد منها وتوفير الخيارات البديلة في حال ظهور تحسس أليرجيائي لدى المريض أو عدم توفر الدواء محلياً.
وبما أن جهاز قارئ التنميط والتحسس الآلي DL 96 مبرمج حسب مرجع CLSI فإن الصادات في التقارير الخاصة به الموضحة في الشكل الآتي تظهر وفق التصنيف السابق





المرجع:
CLSI 2018

Sunday, June 9, 2019

الواسم الورمي ألفا فيتو بروتين


تحليل الواسم الورمي ألفا فيتو بروتين Alpha-fetoprotein

هو تحليل فعال في مراقبة مستويات  بروتين ألفا فيتوبروتين AFP . في الدم
الواسم الورمي ألفا فيتو بروتين Alpha-fetoprotein:
·        ينتج هذا النوع من البروتينات عن طريق الكبد في الجنين أثناء الحمل ويقل تدريجيا بعد الولادة، لكنه يزداد تركيزه بشكل واضح في سرطان الخلية الكبدية وفي بعض أورام الخصية.
·        يعد هذا البروتين واحدا من أهم دلالات الأورام في سرطان الكبد حيث يمكن أن يستخدم في الاكتشاف المبكر للورم في بعض المناطق التي ترتفع بها نسبة الإصابة بهذا النوع من الأورام، كما يتم استخدامه في متابعة تطور المرض والاستجابة للعلاج.
·        ألفا فيتوبروتين AFP دلالة على سرطان الكبد وبعض أنواع أورام الخلايا المولدة العروسية Germ Cell Tumors ، ويُستعمل كذلك مع الهرمون البشري المشيمي الموجه للغدد التناسلية HCG في تصنيف وتحديد مراحل أورام الخصية والمبيض.

يقيس جهاز Chroma II  الواسم الورمي ألفا فيتو بروتين AFP اعتماداً على طريقة الفلورة المناعية FIA والتي تُعد من أكثر التقنيات دقة وحساسية في معايرة التحاليل.
Ø     مجال الكشف (0.5-350) ng/ml.
Ø      المجال الطبيعي للـ AFP أقل من 10 ng/ml.


المواصفات:
نمط العينة Simple type
دم كامل/ مصل/ بلازما
حجم العينة Simple volume
 35ميكروليتر
الزمن الذي تستغرقه المعايرة Assay time
12 دقيقة
مجال الكشف Working range
50.-350 ng/mL.
دقة الأداء Performance
CV <10%
شروط الحفظ Storage
·         2-8 درجة مئوية بالنسبة لمحلول الوقاء الكاشف DB
·         30-4 درجة مئوية بالنسبة لـ الكارتريج
مدة الصلاحية Shelf life
20 شهراً



§        تم قياس تراكيز AFP بشكل مستقل لـ 126 عينات مصلية بوساطة Chroma TM  وmini VIDAS (BioMerieux Inc. France)، وفقًاً لإجراءات الاختبار الموصوفة، وأشارت النتائج إلى ارتباط معنوي قوي (R= 0.99):

المراجع References

-      "Alpha-Fetoprotein Tumor Marker (Blood) ", www.urmc.rochester.edu, Retrieved March 22, 2018. Edited.
-       "Alpha-Fetoprotein Tumor Marker (Blood)", www.healthline.com, Retrieved March 22, 2018. Edited.
-       "Alpha-fetoprotein (AFP) Tumor Marker", [https://labtestsonline.org/tests/alpha-fetoprotein-afp-tumor-marker], www.labtestsonline.org, Retrieved March 22, 2018. Edited.
-       "Alpha-fetoprotein (AFP) Test", medlineplus.gov, Retrieved March 22, 2018. Edited.
-       Bai, D. et. al., 2017. The prognostic correlation of AFP level at diagnosis with pathological grade, progression, and survival of patients with hepatocellular carcinoma, Sci Rep, Vol. 7, doi:  10.1038/s41598-017-12834-1.
-       Sherman, M., 2011. Current Status of Alpha-Fetoprotein Testing, Gastroenterol Hepatol (N Y). Vol. 7, N. (2), P. 113-114.

Monday, May 27, 2019

فقر الدم بعوز إنزيم G6PD



فقر الدم بعوز إنزيم G6PD

إن فقر الدم المرتبط بعوز إنزيم غلكوز-6- فسفات ديهيدروجيناز G6PD من أحد أنماط فقر الدم الانحلالي الناتج عن شذوذ الإنزيمات، وهو مرض وراثي يعاني فيه المريض من عوز في إنتاج إنزيم G6PD والذي يقوم بتحويل غلكوز -6 – فسفات إلى فسفوغلوكونات منتجاً NADPH2 التي تعمل كتميم إنزيمي لأنزيم غلوتاتيون ريدوكتاز والذي يحول بدوره الغلوتاتيون للشكل المؤكسد المسؤول عن إرجاع ميتهيموغلوبين إلى هيموغلوبين طبيعي.
وفي هذه الحالة يؤدي عوز G6PD إلى تراكم الميتهيموغلوبين في الكرية الحمراء معطياً لها شكلاً شاذاً وغير وظيفي يجعلها قابلة للانحلال في حال تناول الشخص المريض مواداً مؤكسدة مثل بعض الأدوية (البريماكين، السلفاميدات....) وبعض الأغذية وخاصة الفول Fava beans.



صنفت منظمة الصحة العالمية WHO فقر الدم بعوز G6PD إلى خمس فئات وفقاً لدرجة نقص الإنزيم ولشدة انحلال الدم بحسب الآتي:
·        الفئة I: نقص شديد في الإنزيم، وانحلال دم مزمن.
·        الفئة II: نقص شديد في الإنزيم (1-10% من النشاط المتبقي)، وانحلال دم حاد متقطع.
·        الفئة III: نقص معتدل في الإنزيم (10-60% من النشاط المتبقي)، وانحلال دم حاد متقطع.
·        الفئة IV: لا يوجد نقص في الإنزيم (60-150% من النشاط).
·        الفئة V: زيادة في نشاط الإنزيم < 150%.

ويكون لتحليل معايرة إنزيم G6PD دوراً هاماً في معرفة وتشخيص أسباب نوبات الدم الانحلالية وتصنيف العوز حسب الفئات السابقة.

وأنتجت شركة TULIP كيتاً خاصاً بتحليل معايرة إنزيم G6PD في الدم الكامل Whole blood من خلال إخراجه من الكريات الحمراء بعد تخريبها وأكسدته فيما بعد للحصول على NADH.
كما ويتميز التحليل من شركة Tulip بأن مواد التفاعل مجففة ومخصصة لكل عينة على حدا في عبوات عاتمة (Monotest) مما يزيد من عمر الكيت ويمنع الهدر والتلوث.




  

المراجع:

·         World Health Organization (WHO)
·         www.tulipgroup.com

Wednesday, May 8, 2019

Alpha thalassemia


أنماط تلاسيميا الفا Alpha thalassemia

تعد تلاسيميا الفا من أحد أنماط فقر الدم الناتج عن الاضطرابات الكمية والقصور في إنتاج سلاسل الغلوبين الفا في هيموغلوبن كريات الدم الحمراء. وهذا المرض شائعاً في جنوب وشرق آسيا.
إن إنتاج سلاسل الغلوبين ألفا يكون خاضعاً لتوجيه أربع مورثات مختلفة يؤدي تحور أو فقد إحداها أو أكثر إلى أنماطاً مختلفة من تلاسيميا ألفا كما هو موضح في الجدول الآتي:

نمط الطفرة (التحور)
النمط المورثي
نوع Hb (الاسم الشائع)
الأعراض والموجودات
لايوجد
α/β = 1 or 2α, 2β
Hb A
حالة طبيعية
غياب أو تحور مورثة واحدة
α/β= 1 or 2α, 2β
Silent alpha thalassemia carrier
لاعرضيين ويمكنهم نقل الخلل وراثياً
غياب أو تحور مورثتان
α/β < 1
Minor alpha thalassemia
تظهر أعراض فقر دم خفيف لدى الأطفال، وتكون كريات الدم الحمراء أصغر من الحجم الطبيعي
غياب أو تحور ثلاث مورثات
4β
تترسب داخل أو خارج الكريات الحمراء وتؤدي إلى تخربها
HbH
يترافق هذا النمط مع ضخامة طحالية، كما تظهر لطاخة الدم المحيطية وجود كريات حمراء صغرية ناقصة الصباغ، وهدفية، ومتفاوتة الحجم.
غياب أو تحور أربع مورثات
4γ
Hb BARTS
استسقاء الجنين (موه) Hydrops fetalis ويؤدي إلى موت الجنين قبل الولادة أو موت حديث الولادة بعد فترة قصيرة منها.
طفرة تؤدي إلى زيادة طول سلسلة غلوبين ألفا 31 حمضاً أمينياً (يصبح طوله 172  بدل 141 حمضاً أمينياً)
2α+31,2β
Hb CS
CONSTANT SPRING
تكون الصورة الدموية شبيهة ب HbH


يكون تشخيص التلاسيميا ألفا بمعرفة القصة الوراثية وملاحظة الأعراض الشائعة وفحص لطاخة الدم المحيطية. كما أنه في حال كان الأبوين حاملين لصفة تلاسيميا ألفا فإنه من المهم جدا فحص الجنين قبل الولادة لإجراء المعالجة اللازمة وزيادة فرصة بقائه على قيد الحياة.
ويتم فحص حالة الجنين بأخذ خزعة من المشيمة بعد الأسبوع 11 من الحمل، أو ببزل عينة من السائل الأمينوسي بعد الأسبوع 16 من الحمل.
ويكون لتقانة الكروماتوغرافيا السائلة دورا هاما في فصل وتحديد كلا من خضابات H, BARTS,CS كما هو الحال في جهاز ARKRAY ADAM HA8180T، وتظهر الأشكال الآتية نماذج من تقاريره:

























المراجع:  UpToDate 2019